中国科学院上海生命科学研究院(简称上海生科院)成立于1999年7月3日，由中国科学院原上海生物化学研究所、上海细胞生物学研究所、上海生理研究所、上海脑研究所、上海药物研究所、上海植物生理研究所、上海昆虫研究所和上海生物工程研究中心等8个生命科学研究机构经过结构调整、体制创新组建而成，中国科学院国家基因研究中心、上海生命科学研究中心、上海实验动物中心、上海文献情报中心等也先后整建制并入。

　　“十五”期间，先后共建或新建了上海生科院/上海交通大学医学院健康科学研究所、营养科学研究所、上海巴斯德研究所、中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所。

　　上海生科院共有生物化学与细胞生物学研究所、神经科学研究所、上海药物研究所、植物生理生态研究所、健康科学研究所、营养科学研究所、上海巴斯德研究所、计算生物学研究所、上海植物逆境生物学研究中心、中科院-二军大转化医学研究院等10个研究机构(上海药物研究所和上海巴斯德研究所为独立法人研究单元)，生命科学信息中心、上海实验动物中心等2个支撑单元，中国科学院上海辰山植物科学研究中心、中国科学院上海临床研究中心、上海工业生物技术研发中心、上海生物医学工程研究中心、中国科学院湖州应用技术研究和产业化中心等5个院地合作共建机构。

　　上海生科院在圆满完成“十二五”收官任务的同时，现正全面推进“十三五”期间“一三五”规划工作，围绕分子细胞、脑科学、分子植物、人口健康及药物五大重点领域，深入实施研究所分类改革，明确科研重点方向，着力提升科技创新能力，继续构筑创新人才高地，努力优化支撑保障条件，加强管理服务，强化统筹协调，促进各项事业全面发展。

　　上海生科院共有在职职工2078人，包括中国科学院院士22人、中国工程院院士2人、中国科学院外籍院士1人、美国国家科学院院士2人、发展中国家科学院院士9人、研究员320人、高级工程师以及高级实验师等副高级专业技术人员374人。

　　上海生科院是国务院学位委员会批准的生物学专业一级学科博士、硕士培养点以及生物工程专业硕士研究生培养点，拥有1个生物学一级学科博士后流动站;共有在学研究生1948人，其中硕士生686人、博士生1262人(含11名留学生)，另有在站博士后282人。