黑龙江省中医药科学院（原黑龙江省中医研究院）的前身是成立于1957年的黑龙江省祖国医药研究所（俗称“祖研”），现已发展成为黑龙江省规模最大的集医疗、科研和研究生教育于一体的综合性中医药机构，先后荣获“全省小康建设先进集体”和“全国卫生系统先进集体”的荣誉称号。随着规模的发展和功能的不断健全，2013年黑龙江省中医研究院正式更名为黑龙江省中医药科学院。

　　黑龙江省中医药科学院占地面积5万平方米，建筑面积8万平方米，现有人员1300余人，具有正、副高级职称专家222人，其中享受省政府和国务院特殊津贴专家25人，国家级名中医和省级名中医24人。我院现有国家临床重点专科4个，国家中医药重点学科和重点专科16个，国家中医重点研究室1个，国家中医药科研三级实验室5个，省政府重点学科领军人才梯队7个，省重点实验室1个。同时我院下设中药、中医临床、针灸、中西医结合、中医基础理论等5个研究所，国家中药剂型改革基地和《中国中医药科技》杂志社设在我院。

　　黑龙江省中医药科学院医疗编制床位1000张（其中总院500张，南岗分院500张），设内、外、妇、儿、骨伤、针灸、推拿、口腔、眼科等一级临床科室19个，肾病科、心血管科、脾胃病科、肺病科、内分泌科等二级临床科室 16个，全院科室总数49个，设药剂、医学检验科、医学影像科（放射线、CT、核磁、DR、彩超、钼靶）、病理科、手术室等医技科室共计23个。 肾病科、脑病（针灸科）为国家临床重点专科；肾病科、脑病（针灸科）、心血管科、皮肤科、脾胃病科、肺病科、内分泌科和临床药学为国家中医重点专科；中医肾病学、中药药剂学、脑病（针灸学）、中医皮肤病学、中医肺病学、中医临床药学、中医文化学和中医男科为国家中医药重点学科。

　　在研究生教育方面，黑龙江省中医药科学院拥有中医学、中西医结合、中药学3个硕士一级学科学位授予权，拥有硕士研究生导师55名，博士研究生导师6名，现在院研究生186名。1999年黑龙江省中医药科学院被人事部批准为博士后科研工作站，现已有9名博士后出站，有5名博士后在站工作。

　　建院以来，黑龙江省中医药科学院共取得科研成果266项，获得部省级以上科技奖励92项，共研制出中药新产品43个投放市场，其中包括“刺五加”、“满山红”、“双黄连粉针剂”等具有里程碑意义的名牌产品和“宁神灵”、“骨筋丹”、“丹王颗粒”、“葛根芩连微丸”、“芩百清肺浓缩丸” 等具有自主知识产权的中药新产品。据不完全统计，黑龙江省中医药科学院转让我省企业的中药产品年创产值近10亿元，其中“双黄连粉针剂”自投产以来已创产值达40亿元以上， 2010年被黑龙江省委、省政府评为推进“八大经济区”和“十大工程”建设先进单位，为黑龙江省医药工业和中药产业化发展提供了强有力的科技支撑。